Se evidencia su proceso de conversión tras asistir a la Ermita de los Mártires y escuchar la predicación de Juan de Ávila el 20 de enero, durante la fiesta de San Sebastián con la homilía sobre la misericordia de Dios, la injusta distribución de las riquezas y la necesidad de atender a todas las personas sin distinción, le generan un choque profundo que lo conmueve. Período importante en su vida por los siguiente sucesos: es tomado por loco e ingresado al Hospital Real de Granada, funda su primer Hospital e instaura así una manera de vivir y servir; su estilo despierta admiración y motiva la adhesión de voluntarios que le brindan su tiempo y conocimientos.

Fallece en Granada el 8 de marzo a los 55 años en la Casa de los García de Pisa, víctima de una pulmonía a consecuencia de haber salvado a un joven de la crecida del río, tras una vida de entrega infatigable a los demás y de dedicación total al servicio de los pobres y enfermos. Tocaron las campanas, la noticiad de la muerte de Juan de Dios se propagó rápidamente por Granada, la gente salía de sus casas para darle el último adiós. Juan de Dios era el hombre de todos, el hombre de la calle, del que ya casi nadie dudaba de que su obra era cosa de Dios.

El 01 de enero, el Papa Pío V aprueba la “Congregación de los Hermanos de San Juan de Dios” y años más tarde, en 1586 el Papa Sixto V aprueba como “Orden Hospitalaria de San Juan de Dios”.

Fue beatificado por el papa Urbano VIII el 1 de setiembre. En el año 1690 es canonizado por el papa Alejandro VIII. >